Сериал «Филин» рассказывает историю Алексея Филиппова, хирурга, который уже десять лет не может найти покоя. После трагической гибели жены сон для него стал почти невозможным, а ночи превратились в бесконечную пытку. Вместо отдыха он бродит по пустым коридорам больницы или пытается заглушить прошлое, пока не обнаруживает странное утешение.

Неожиданно для себя самого Алексей начинает вникать в запутанные обстоятельства пациентов, поступающих в его травматологию. То, что начиналось как попытка отвлечься, постепенно складывается в цепочку улик и версий. Он понимает, что его медицинский опыт и внимание к деталям дают ему необычный взгляд на происшествия, которые со стороны кажутся обычными несчастными случаями.

Постепенно вокруг Филиппова собирается своеобразный кружок — коллеги-врачи и знакомый участковый, которые сначала скептически, а потом все более вовлеченно помогают ему распутывать клубки. Расследование становится для Алексея единственным лекарством, тем, что на несколько часов дарит ему забытье и подобие сна, возвращая смысл в его бессонные сутки.